Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD247P20963 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD247P20963 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD247P20963 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD247P20963 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms