Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PVALBP20472 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PVALBP20472 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PVALBP20472 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PVALBP20472 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PVALBP20472 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PVALBP20472 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PVALBP20472 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PVALBP20472 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms