Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDSP20132 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDSP20132 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDSP20132 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDSP20132 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDSP20132 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDSP20132 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms