Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPCAMP16422 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPCAMP16422 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms