Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC130P13994 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC130P13994 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC130P13994 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC130P13994 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms