Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAMP11215 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGAMP11215 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms