Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms