Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms