Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms