Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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