Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSP90AB1P08238 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HSP90AB1P08238 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms