Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSN3P07498 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN3P07498 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms