Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms