Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB11O95342 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms