Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45GO95257 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45GO95257 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms