Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms