Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms