Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK4O60575 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms