Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6DO43924 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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