Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN4O43707 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN4O43707 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms