Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBFA2T2O43439 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms