Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP3O43295 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms