Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms