Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD28O15084 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms