Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELL2O00472 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELL2O00472 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELL2O00472 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ELL2O00472 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELL2O00472 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ELL2O00472 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ELL2O00472 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELL2O00472 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELL2O00472 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELL2O00472 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ELL2O00472 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ELL2O00472 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELL2O00472 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms