Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms