Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC00587B1AMM8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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