Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC69A6NI79 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms