Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms