Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms