Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRGMA1A4Y4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms