Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF106-203ENST00000565380 5677 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AP000997.2-201ENST00000564619 8400 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 VWA5A-202ENST00000392744 2691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FOXJ2-202ENST00000428177 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC105105.1-201ENST00000591360 2553 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ANXA2-203ENST00000421017 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AKAP2-201ENST00000259318 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 UBA7-201ENST00000333486 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC098934.2-201ENST00000456105 2321 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 KRTAP16-1-201ENST00000391352 1554 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FAM173B-201ENST00000280330 1928 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TRBV6-4-201ENST00000390360 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL031864.1-201ENST00000392075 423 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC104088.1-201ENST00000445613 510 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL139237.1-201ENST00000446107 513 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SL18P-201ENST00000466851 291 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC022762.1-201ENST00000529961 816 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MORN5-205ENST00000536616 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ATP5J2P5-201ENST00000537967 258 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PHBP20-201ENST00000603694 818 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TPK1-203ENST00000378099 2283 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 GP2-203ENST00000381360 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RGS22-218ENST00000617334 4253 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LINC01016-201ENST00000506222 3151 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF397-203ENST00000355632 2162 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 OTUD6B-205ENST00000615618 3434 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PROM2-202ENST00000317668 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TTF1-203ENST00000612514 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DDX10-201ENST00000322536 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PHC1-214ENST00000544916 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC097382.2-201ENST00000500031 4300 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 GALNT15-201ENST00000339732 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SPOCD1-214ENST00000533231 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 VSTM5-202ENST00000409977 2969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 HAUS6P1-201ENST00000421150 1551 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SLC6A20-201ENST00000353278 5247 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PNPLA1-202ENST00000388715 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL132655.3-201ENST00000603095 1619 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 KIAA0087-201ENST00000242109 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MCF2L-206ENST00000397021 576 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC004448.4-209ENST00000421796 684 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL139246.1-201ENST00000424657 455 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms