Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC61A1-202ENST00000424880 3238 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM246-201ENST00000374847 4223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WRAP53-201ENST00000316024 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A8-203ENST00000430500 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS3-217ENST00000588462 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-202ENST00000324631 3446 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR2-204ENST00000409459 3420 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068491.4-201ENST00000622940 3380 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EARS2-201ENST00000449606 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDILT-201ENST00000302451 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.8 ms