Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CFAP45-202ENST00000426543 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TP53-213ENST00000510385 2404 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TP53-223ENST00000618944 2404 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 EDRF1-202ENST00000356792 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CPEB1-207ENST00000611031 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 BTD-206ENST00000437172 2097 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC008764.9-201ENST00000624284 2505 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MCOLN3-203ENST00000370589 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AP000552.1-201ENST00000447720 3215 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MDH1B-201ENST00000374412 2553 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CASP7-210ENST00000614447 2555 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 FANCB-202ENST00000398334 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DDX10-201ENST00000322536 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms