Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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