Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNA5SP101-201ENST00000517036 108 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KRT7-214ENST00000638501 398 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NECAP1-210ENST00000638237 2517 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CDY4P-201ENST00000418290 1513 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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