Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms