Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS5Q9UPZ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms