Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF18Q9UNG2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms