Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMCC3Q9ULS5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms