Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms