Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms