Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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RABGEF1Q9UJ41 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1Q9UJ41 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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RABGEF1Q9UJ41 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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