Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPC1L1Q9UHC9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms