Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFP1

FAM198A, Protein FAM198A, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198AQ9UFP1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM198AQ9UFP1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM198AQ9UFP1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM198AQ9UFP1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198AQ9UFP1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms