Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms