Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
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