Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms