Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MSRB1Q9NZV6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MSRB1Q9NZV6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MSRB1Q9NZV6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
MSRB1Q9NZV6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MSRB1Q9NZV6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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