Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBP1Q9NZI7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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